رییس سازمان بسیج مستضعفین از کاهش بودجه بسیج در سال 93 انتقاد کرد. سردار محمدرضا نقدی در گفت‌وگو با «مهر» با «تقدیر از اقدام دولت تدبیر و امید در ارایه به‌موقع لایحه بودجه سال 1393 به مجلس» گفته: «انتظار کاهش بودجه این سازمان از سوی دولت را نداشتیم.»در لایحه تقدیمی بودجه دولت به مجلس، بودجه بسیج نسبت به سال گذشته بیش از دوهزار‌میلیاردریال کاهش داشته است. نقدی در پاسخ به اینکه آیا رایزنی با مقامات دولتی و مجلس برای افزایش بودجه بسیج صورت گرفته است؟ گفت: «ما با مسوولان دولتی در این خصوص صحبت کردیم و چنین انتظاری برای کاهش بودجه بسیج نداشتیم. منتها ما وظایف خود را به هر حال انجام می‌دهیم.» او افزود: «بسیج متکی به پول نیست و هرچقدر که بودجه به بسیج بدهند کارهایی را که بتوانیم انجام داده و خدماتی که در حوزه سازندگی می‌توان به مردم ارایه کرد را ارایه خواهیم داد اگر هم بودجه کافی ندهند ما باز هم کار خودمان را انجام می‌دهیم.» او گفته: «این برخورد با بسیج انتظار نمی‌رفت و بسیج چنین انتظاری از دولت در کاهش بودجه این سازمان مهم نداشت.»
بودجه سازمان بسیج مستضعفین طی سال‌های اخیر سیر صعودی داشته است. بودجه این سازمان در سال 1387 حدود سه‌هزارو115‌میلیاردریال بود که در سال 88 با افزایش 30‌درصدی به حدود چهارهزارو300میلیاردریال رسید. در سال‌ 89 این میزان به حدود چهارهزارو864‌میلیاردریال، در سال 90، پنج‌هزارو345‌میلیاردریال، در سال 91، حدود هفت‌هزارو152‌میلیاردریال و در سال 92 نیز به حدود هشت‌هزارو142‌میلیاردریال افزایش پیدا کرد. دو سال پیش نیز نمایندگان مجلس هشتم در جلسه‌ای، به یک فوریت طرح کمک به اجرای ماموریت‌های فرهنگی جوانان بسیج رای دادند که بر اساس آن هر سال معادل نیم‌درصد از محل افزایش درآمد فروش نفت در اختیار سازمان بسیج مستضعفین قرار می‌گرفت، این طرح با 110رای موافق، 9رای مخالف و 20رای ممتنع از مجموع 197 نماینده حاضر به تصویب رسید. در لایحه بودجه سال 93 تقدیمی دولت یازدهم به مجلس، بودجه سازمان بسیج به شش‌هزارو272‌میلیاردریال رسید که نسبت به سال گذشته 22‌درصد کاهش داشته است.